Воздушный транспорт в Республике Хакасия представлен ЗАО "Авиакомпания "Абакан Авиа", филиалом ОАО "Аэрофлот" и ОАО "Аэропорт Абакан", базирующимися на территории республики. Кроме того, более 50 эксплуатантов и предприятий гражданской авиации имеют договорные отношения с ОАО "Аэропорт Абакан" на аэропортовое и наземное обслуживание воздушных судов.
ОАО "Аэропорт Абакан" - гражданский международный аэропорт федерального значения, обеспечивающий транспортные связи Республики Хакасия с другими регионами Российской Федерации и в силу особенностей географического расположения являющийся основным запасным вариантом для аэропортов Красноярска и Новосибирска. Аэропорт расположен в северной части города Абакана, недалеко от городской черты, связан с городом автобусным и троллейбусным сообщением. Аэропорт единственный в регионе (Республика Хакасия и юг Красноярского края) способен принимать практически все типы воздушных средств, в том числе Ан-72, Ан-74, Ан-124, Ил-62, Ил-76, Ил-86, Ту-134, Ту-154, Airbus A319, Airbus А320.
В настоящее время аэропорт связан регулярными авиарейсами с Москвой (ежедневно), Норильском (один рейс в неделю).
За 2011 год ОАО "Аэропорт Абакан" было обслужено 102,6 тыс. пассажиров, отправлено и принято 999,64 т грузов, принято и отправлено 769 воздушных судов.
В общем грузообороте и пассажирообороте предприятий транспорта доля воздушного транспорта незначительна и составляет менее 0,1%.
Развитие международного транспортно-логистического узла на базе аэропорта "Абакан" перспективно с точки зрения привлечения инвестиций, в том числе иностранных, в будущую агломерацию, а также развития туристской отрасли республики.