Государственным заказчиком и координатором Программы выступает Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия.
Исполнителями Программы являются Республиканская ветеринарная служба Республики Мордовия, государственные ветеринарные учреждения Республики Мордовия.
Государственный заказчик несет ответственность за реализацию Программы. Республиканские ветеринарные учреждения Республики Мордовия представляют отчет о реализации Программы в республиканскую ветеринарную службу Республики Мордовия не позднее 1 марта. Отчет о выполнении ведомственной целевой программы, включая меры по повышению эффективности их реализации, представляется республиканской ветеринарной службой Республики Мордовия в Министерство экономики Республики Мордовия и Министерство финансов Республики Мордовия ежегодно не позднее 1 апреля, в составе первой части докладов о результатах и основных направлениях деятельности субъектов бюджетного планирования.