Подпрограмма предусматривает реализацию следующих основных мероприятий:
строительство и реконструкция сооружений инженерной защиты населения и объектов экономики от негативного воздействия вод;
капитальный ремонт гидротехнических сооружений для обеспечения защиты населения и объектов экономики от негативного воздействия вод;
восстановление и экологическая реабилитация водных объектов (природоохранные мероприятия).