Выделяются следующие принципы ведения регионального генетического банка:
принцип научности;
популяционный принцип;
принцип неизменности образца;
принцип непрерывности сохранения.
Принцип научности: работы по ведению регионального генетического банка (отбор и сохранение образцов, контроль их жизнеспособности и генетической стабильности) ведутся на основе научно-обоснованной методики (далее именуется - методика), разрабатываемой и утверждаемой учреждением по согласованию с Комитетом.
Популяционный принцип: отбор образцов для сохранения в региональном генетическом банке ведется с учетом естественного генетического разнообразия популяций редких видов.
Принцип неизменности образца: сохранение каждого образца регионального генетического банка обеспечивает его генетическую неизменность и соответствие генотипам природной популяции, являющейся источником образца.
Принцип непрерывности сохранения: сохранение образцов регионального генетического банка ведется на постоянной основе. Сохранение образца может быть прервано лишь на основании изменений, внесенных в перечень популяций редких видов, сохраняемых в региональном генетическом банке.