Управление программой возлагается на комитет здравоохранения администрации городского округа "Город Чита". Текущий контроль за ходом реализации программы осуществляют комитет здравоохранения администрации городского округа "Город Чита" и комитет экономики администрации городского округа "Город Чита". Финансовый контроль за целевым использованием средств - комитет по финансам администрации городского округа "Город Чита".