Система управления программой включает организацию управления программой, реализацию намеченных мероприятий и контроль за ходом реализации программы.
Комитет по развитию инфраструктуры администрации городского округа "Город Чита" организуют работу по реализации программы в рамках своих полномочий:
- разрабатывает и утверждает в установленном порядке схему транспортной маршрутной сети городских пассажирских перевозок и концепцию организации пассажирских перевозок;
- проводит конкурс отбора на пассажирские перевозки и заключает договора на перевозку пассажиров.
Контроль за соблюдением расписания движения на муниципальных маршрутах осуществляется МП "Центральная диспетчерская служба".
Текущий контроль за ходом выполнения мероприятия программы осуществляют комитет экономики администрации городского округа "Город Чита".
Финансовый контроль за целевым использованием бюджетных средств осуществляет комитет по финансам администрации городского округа "Город Чита".