Заказник "Черноозерский" расположен в границах:
от северной оконечности выдела 5 квартала 16 колхоза "Аврора" Чагодощенского сельского участкового лесничества Чагодощенского лесничества (далее - Чагодощенское сельское участковое лесничество) на юго-восток, вдоль северной границы выделов 5, 6 указанного квартала до пересечения с южной границей квартала 17 Чагодощенского сельского участкового лесничества.
Далее на юго-восток, вдоль северо-восточной границы кварталов 17, 18 Чагодощенского сельского участкового лесничества с поворотом на юг, вдоль восточной границы квартала 18 Чагодощенского сельского участкового лесничества до пересечения ее с северной границей квартала 264 Белокрестского участкового лесничества Чагодощенского лесничества (далее - Белокрестское участковое лесничество). Далее поворот на северо-запад, вдоль южной границы квартала 18 Чагодощенского сельского участкового лесничества, до пересечения с восточной границей квартала 263 Белокрестского участкового лесничества. Далее на юго-запад, вдоль юго-восточной границы кварталов 263, 262 Белокрестского участкового лесничества, поворот на северо-запад вдоль южной границы квартала 262 Белокрестского участкового лесничества до западной его оконечности. Далее поворот на северо-восток вдоль границы того же квартала, далее поворот на север до пересечения с южной границей квартала 29 Чагодощенского сельского участкового лесничества.
Далее на запад с поворотом на северо-запад вдоль границы квартала 29 Чагодощенского сельского участкового лесничества до пересечения с юго-восточной границей квартала 27 Чагодощенского сельского участкового лесничества. Далее на запад, вдоль западной границы квартала 27 Чагодощенского сельского участкового лесничества, с поворотом на север вдоль северной границы того же квартала до пересечения с восточной границей квартала 15 Чагодощенского сельского участкового лесничества. Далее вдоль западной границы квартала 15 Чагодощенского сельского участкового лесничества до пересечения ее с рекой Черной. Далее на северо-восток вдоль левого берега реки Черной до северной оконечности выдела 5 квартала 16 Чагодощенского сельского участкового лесничества.
Карта-схема территории заказника приведена в приложении к настоящему Положению.
Координаты центральной точки заказника "Черноозерский": 58°52'30" с. ш., 35°25'00" в. д. (точка А на схеме).