На территории Вологодской области перевозки грузов и пассажиров железнодорожным транспортом осуществляет Северная железная дорога, в западной части области - Октябрьская железная дорога.
Северная пригородная пассажирская компания осуществляет пригородные перевозки по следующим направлениям: Вологда - Череповец, Череповец - Бабаево, Вологда - Буй, Вологда - Вожега, Коноша - Вожега и Вологда - Данилов. Северо-Западная пригородная пассажирская компания осуществляет перевозку пассажиров по территории области по следующим маршрутам: "Подборовье - Хвойная - Подборовье" (транзит по территории области) 2 раза в неделю (вторник, четверг) и "Тихвин - Бабаево - Тихвин".
Перевозки пассажиров осуществляются 26 пригородными поездами. Все железнодорожные пути общего пользования на территории области электрифицированы.