5.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором Мурманской области.
5.2. Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство функций и реализацию государственной политики в установленных сферах деятельности.
Министр имеет заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности министром по согласованию с соответствующим заместителем Губернатора Мурманской области - куратором и Губернатором Мурманской области.
Количество заместителей министра устанавливается Правительством Мурманской области.
Один из заместителей министра одновременно является главным государственным инженером - инспектором гостехнадзора Мурманской области.
5.3. Структурными подразделениями Министерства являются отделы Министерства, которые в свою очередь могут состоять из секторов, секторы и обособленные подразделения Министерства.
5.4. Министр:
5.4.1. Распределяет обязанности между своими заместителями.
5.4.2. Утверждает положения о структурных подразделениях Министерства, утверждает должностные регламенты сотрудников Министерства.
5.4.3. Назначает на должность с обязательным согласованием с Министерством имущественных отношений Мурманской области и освобождает от должности (с уведомлением Министерства имущественных отношений Мурманской области) руководителей подведомственных Министерству организаций.
5.4.4. Утверждает уставы подведомственных Министерству организаций по согласованию с Министерством имущественных отношений Мурманской области, согласовывает их штатные расписания и утверждает бюджетные сметы либо государственные задания в порядке, установленном законодательством.
5.4.5. Назначает на должность и освобождает от должности работников Министерства, а также заключает (по согласованию с Министерством имущественных отношений Мурманской области) и расторгает трудовые договоры (с уведомлением Министерства имущественных отношений Мурманской области) с руководителями подведомственных Министерству организаций.
5.4.6. Решает в соответствии с законодательством Российской Федерации и законодательством Мурманской области о государственной гражданской службе вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы в Министерстве.
5.4.7. Утверждает по согласованию с заместителем Губернатора Мурманской области - куратором структуру и штатное расписание Министерства в пределах установленной Правительством Мурманской области численности работников, смету расходов на содержание Министерства в пределах утвержденных на соответствующий период ассигнований, предусмотренных в областном бюджете.