Основными задачами МКЭМ являются:
- разработка принципов государственной политики в области экологического мониторинга Удмуртской Республики;
- рассмотрение предложений по созданию ТГСЭМ в Удмуртской Республике;
- координация деятельности всех заинтересованных министерств, ведомств и организаций в области экологического мониторинга на территории Удмуртской Республики;
- подготовка предложений для Правительства Удмуртской Республики по вопросам организации и функционирования ТГСЭМ.