Управление Программой осуществляется государственными заказчиками Республиканской программы: Министерством промышленности и транспорта Удмуртской Республики (государственным заказчиком - координатором) и Министерством лесного хозяйства Удмуртской Республики (государственным заказчиком).
Государственные заказчики обеспечивают достижение значений целевых индикаторов и показателей эффективности, являются главными распорядителями бюджетных средств, выделяемых на реализацию Программы, отчитываются перед Правительством Удмуртской Республики о ходе реализации Программы.