Контроль за реализацией Программы осуществляет Правительство Удмуртской Республики, постоянная комиссия Государственного Совета Удмуртской Республики по науке, образованию, культуре и молодежной политике.
Республиканские заказчики Программы ежегодно до 1 февраля направляют в Министерство экономики Удмуртской Республики и Министерство финансов Удмуртской Республики доклады о ходе работы по Программе и эффективности использования финансовых средств.
Министерство экономики Удмуртской Республики с участием Министерства финансов Удмуртской Республики до 1 марта каждого года представляет в Правительство Удмуртской Республики доклад о ходе реализации Программы.