Земли водного фонда представлены реками (Енисей, Абакан и др.), озерами (Шира, Иткуль, Беле, Черное и др.), искусственными водохранилищами (Красноярское, Саяно-Шушенское, Майнское), рядом более мелких водных объектов совокупной площадью 74,9 тыс. га, находящихся в государственной и муниципальной собственности.
К землям водного фонда в Республике Хакасия относятся земли, занятые водными объектами, а также земли, выделенные под полосы отвода гидротехнических и иных сооружений, магистральных, межхозяйственных каналов и коллекторов.