Город имеет выгодное экономико-географическое расположение на северо-западе европейской части России, расстояние от Череповца до Москвы составляет 620 км, а до Санкт-Петербурга - 475 км.
Город расположен на пересечении железнодорожных и автомобильных дорог с водной системой Волго-Балтийского пути и имеет выход к пяти морям.
По административной принадлежности город входит в Северо-Западный федеральный округ.