По ключевым показателям экологической нагрузки г. Новочебоксарск является территорией с самой экологически неблагоприятной ситуацией в Чувашской Республике.
В атмосферном воздухе сохраняется превышение предельно допустимых концентраций по фенолу, формальдегиду, бензопропилену, аммиаку.
891 га территории города занимают отходы военного химического производства.
В санитарно-защитной зоне промышленных предприятий проживает свыше 1234 семей.