Решение задачи улучшения экологического состояния водных объектов предполагает выполнение мероприятий, направленных на экологическую реабилитацию водных объектов, в том числе расчистку малых рек Ростовской области, которые утратили способность к самоочищению.
В Программу включены первоочередные мероприятия по расчистке участков рек бассейнов Калитва, Кагальник, Тузлов, сформированные в соответствии с "Комплексным планом мероприятий по предотвращению и минимизации негативного воздействия вод и оздоровлению водных объектов в бассейне р. Тузлов на территории Ростовской области", разработанным Северо-Кавказским филиалом федерального государственного унитарного предприятия "Российский научно-исследовательский институт комплексного использования и охраны водных ресурсов" по заказу Администрации Ростовской области в 2006 году; "Программой восстановления водности водных объектов бассейна реки Кагальник (Азовский) в Ростовской области", разработанной ООО "Экозем" по заказу Администрации Ростовской области в 2004 году; "Комплексным планом управления водохозяйственной деятельностью в бассейне р. Калитва, в том числе разработка проектно-сметной документации на первоочередные мероприятия", разработанным ООО "Экозем" по заказу Администрации Ростовской области в 2006 году; а также на основании заявок муниципальных образований области.
Одним из основных факторов, влияющих на качество гидрологических прогнозов, является обеспеченность данными наблюдений за водными объектами.
В границах Ростовской области водные объекты представлены 26 бассейнами малых и средних рек, а также частями русел рек Дон и Северский Донец. В 2011 году в рамках полномочий Ростовской области начато осуществление водного мониторинга состояния бассейнов рек Тузлов и Кундрючья. В 2012 году запланировано ведение мониторинга бассейна реки Калитва.
В рамках реализации мероприятий по развитию государственной наблюдательной сети Программой планируется увеличение количества бассейнов водных объектов, на которых осуществляется мониторинг водных объектов, до 12 единиц.