Реализация цели и задач стратегии инновационного развития Пензенской области, разработка и осуществление комплексов мероприятий по их реализации должны проводиться в соответствии со следующими основными принципами:
- согласованность целей инновационной политики со стратегическими целями социально-экономического развития региона;
- интеграции имеющихся в Пензенской области ресурсов и организационных структур, инновационной, инвестиционной, промышленной, аграрной, научно-технической и научно-образовательной деятельности с целью воздействия на экономику в приоритетных направлениях инновационного развития;
- использование в целях инновационного развития как внутренних, так и внешних ресурсов;
- комплексность и системность стратегического управления инновационной политикой региона;
- итеративный характер стратегического управления (непрерывное совершенствование на основе анализа внутренних и внешних факторов инновационного развития региона);
- принцип разграничения функций - стратегическое управление инновационным развитием региона строится на разделении полномочий между органами региональной власти, органами местного самоуправления, руководством организаций инновационной инфраструктуры и предприятий региона;
- принцип научной обоснованности программ и других плановых решений для обеспечения качественных изменений в экономике;
- принцип приоритетности - инновационное развитие экономики региона должно являться приоритетом в деятельности органов государственной власти и хозяйствующих субъектов региона;
- принцип открытости и гласности инновационной политики - участие представителей субъектов инновационной деятельности, их саморегулируемых организаций в выработке и реализации государственной инновационной политики.