Межведомственную и межрегиональную координацию и контроль за ходом реализации программных мероприятий осуществляет Кабинет Министров Республики Татарстан. Контроль за использованием бюджетных средств Республики Татарстан, выделяемых на реализацию Программы, осуществляет Счетная палата Республики Татарстан в рамках предоставленных полномочий.
Функции текущего мониторинга реализации Программы выполняют Торгово-промышленная палата Республики Татарстан и Агентство по развитию предпринимательства Республики Татарстан, оказывая содействие в развитии инфраструктуры поддержки малого предпринимательства в Республике Татарстан.
Ход выполнения Программы регулярно рассматривается на заседаниях профильного комитета Государственного Совета Республики Татарстан.