5.1. Управление возглавляет руководитель, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Главой Республики Саха (Якутия).
5.2. Руководитель Управления имеет двух заместителей, в том числе одного первого заместителя, назначаемых на должность и освобождаемых от должности Главой Республики Саха (Якутия).
5.3. Руководитель Управления:
5.3.1. Распределяет обязанности между своими заместителями.
5.3.2. Утверждает структуру и административные регламенты Управления.
5.3.3. Определяет и утверждает функции структурных подразделений Управления и положения о них.
5.3.4. Назначает в установленном порядке на должность и освобождает от замещения должности государственных гражданских служащих Управления, утверждает их должностные регламенты.
5.3.5. Утверждает штатное расписание Управления в пределах установленной штатной численности и фонда оплаты труда, смету расходов на содержание Управления в пределах выделяемых ассигнований.
5.3.6. Представляет Главе Республики Саха (Якутия) для утверждения ежегодный План контрольной деятельности Управления.
Принимает решения о проведении внеплановых контрольных мероприятий:
в связи с поступлением обращений (поручений) Главы Республики Саха (Якутия), Председателя Правительства Республики Саха (Якутия), органов прокуратуры, правоохранительных органов, граждан и иных государственных органов и организаций;
по результатам рассмотрения акта и иных материалов выездной проверки (ревизии) в установленном порядке.
5.3.7. Направляет Главе Республики Саха (Якутия) и Председателю Правительства Республики Саха (Якутия) ежегодные и ежеквартальные отчеты о деятельности Управления, а также отчеты по итогам проведенных контрольных мероприятий, аналитическую информацию о деятельности исполнительных органов государственной власти Республики Саха (Якутия) и органов местного самоуправления Республики Саха (Якутия), организаций по исполнению действующего законодательства.
5.3.8. Подписывает (утверждает) нормативные правовые акты Управления. Право подписи (утверждения) имеют также заместители руководителя.
5.3.9. Издает приказы по вопросам организации деятельности Управления, представления, предписания и уведомления о применении бюджетных мер принуждения по итогам проведенных контрольных мероприятий.
5.3.10. Организует ведение бухгалтерского учета в Управлении и обеспечивает представление отчетности в порядке, установленном законодательством.
5.3.11. Представляет в установленном порядке особо отличившихся работников Управления к присвоению почетных званий и награждению государственными наградами.
5.3.12. Принимает решения о премировании должностных лиц Управления на основании утверждаемого им Положения о премировании.