5.1. Руководство Управлением осуществляет начальник Управления, который назначается и освобождается от должности Главой Карачаево-Черкесской Республики по согласованию с уполномоченным федеральным органом исполнительной власти в области лесных отношений в соответствии с Лесным кодексом Российской Федерации.
Начальник Управления одновременно по должности является Главным государственным лесным инспектором в Карачаево-Черкесской Республике.
5.2. Начальник Управления имеет первого заместителя и заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности Президиумом Правительства Карачаево-Черкесской Республики по представлению начальника Управления.
5.3. В период временного отсутствия начальника Управления (в связи с болезнью, командировкой и по другим причинам) его обязанности исполняет первый заместитель начальника Управления.
В случае невозможности исполнения полномочий начальника Управления первым заместителем начальника Управления, их исполняет один из заместителей начальника Управления в соответствии с действующим законодательством.
Исполняющий обязанности начальника Управления обладает правом подписи документов, в том числе финансовых документов, и правом решения текущих вопросов, возникающих в процессе деятельности Управления.
5.4. Начальник Управления:
5.4.1. Осуществляет руководство деятельностью Управления на основе единоначалия, несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Управление задач и функций.
5.4.2. Действует без доверенности от имени Управления, представляет его интересы в органах государственной власти, судах, других организациях, заключает договоры и соглашения, выдает доверенности.
5.4.3. Распределяет обязанности между первым заместителем и заместителями начальника Управления и определяет их полномочия.
5.4.4. Издает в пределах своей компетенции приказы и распоряжения, утверждает инструкции, дает указания по вопросам деятельности Управления и проверяет их исполнение.
5.4.5. Утверждает в установленном порядке положения о структурных подразделениях Управления.
5.4.6. Вносит в установленном порядке на рассмотрение Главы Карачаево-Черкесской Республики и Правительства Карачаево-Черкесской Республики проекты нормативных правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Управления.
5.4.7. В соответствии с законодательством Российской Федерации и Карачаево-Черкесской Республики о государственной гражданской службе решает вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы Карачаево-Черкесской Республики в Управлении.
5.4.8. В установленном порядке назначает на должность и освобождает от должности работников Управления, замещающих должности, не являющиеся должностями государственной гражданской службы Карачаево-Черкесской Республики.
5.4.9. Применяет меры поощрения к работникам Управления за достигнутые положительные результаты их деятельности, налагает на них дисциплинарные взыскания за нарушения и упущения в работе.
5.4.10. Вносит предложения о присвоении почетных званий и награждении государственными наградами особо отличившихся работников Управления, руководителей и специалистов республиканских государственных казенных учреждений (лесничеств), Карачаево-Черкесских республиканских государственных унитарных предприятий (лесхозов), Карачаево-Черкесских республиканских государственных бюджетных учреждений.
5.4.11. Организует проведение конкурсов на замещение вакантных должностей руководителей Карачаево-Черкесских республиканских государственных унитарных предприятий (лесхозов) в порядке и сроки, установленные Правительством Карачаево-Черкесской Республики, по результатам которых вносит уполномоченному органу исполнительной власти Карачаево-Черкесской Республики, осуществляющему функции в области приватизации и полномочия собственника, в том числе права акционера, в сфере управления государственным имуществом Карачаево-Черкесской Республики, представления на назначение на должности руководителей вышеуказанных предприятий.
5.4.12. Организует проведение аттестации руководителей и сотрудников республиканских государственных казенных учреждений (лесничеств), Карачаево-Черкесских республиканских государственных унитарных предприятий (лесхозов), Карачаево-Черкесских республиканских государственных бюджетных учреждений в порядке и сроки, установленные Правительством Карачаево-Черкесской Республики.
5.4.13. Распоряжается в порядке, установленном бюджетным законодательством Российской Федерации, средствами в пределах утвержденных смет.
5.4.14. Несет персональную ответственность за состояние антикоррупционной работы в Управлении.
5.4.15. Осуществляет другие полномочия в соответствии с федеральным и республиканским законодательством.
5.5. Ликвидация и реорганизация Управления осуществляется по решению Главы Карачаево-Черкесской Республики в соответствии с действующим законодательством.