Общая площадь заказника составляет 263 556 га, в т.ч. лесных земель 212 197 га.
Кадастровые номера земельных участков заказника:
14:19:204001:7, N 3784-1419/201/10-3778
14:19:204001:16, N 3786-1419/201/10-3780.
Заказник состоит из двух изолированных участков: Токкинского (115 127 га) и Алгамского (148 429 га).
Описание границ проводилось по карте масштаба 1:50 0000, изданной ГУГК при СМ СССР в 1988 г. Система координат 1942 года.