Транспортная инфраструктура имеет ключевое значение для развития туризма.
В Вологодской области имеется сложившаяся транспортная система:
- железнодорожная (Северная железная дорога);
- автомобильная (Вологда - Новая Ладога, Москва - Архангельск, Чекшино - Тотьма - Никольск, Тотьма - Нюксеница - Великий Устюг ("Сухонский тракт"), Урень - Шарья - Никольск - Котлас, Вологда - Медвежьегорск);
- водная (Рыбинское водохранилище, Шекснинское водохранилище, река Шексна, озера Белое, Онежское, Кубенское);
- воздушная (3 аэропорта в городах Череповце, Вологде, Великом Устюге).
Первое место по значимости занимает железнодорожный транспорт. Железнодорожные магистрали соединяют районы области с Москвой и Санкт-Петербургом, Архангельской и Мурманской областями, республикой Коми, Уралом.
Хорошие предпосылки для развития имеет автомобильный транспорт, обладающий определенными преимуществами (скорость, маневренность, высокая проходимость, доставка туристов непосредственно в пункт назначения, возможность остановки в любом месте). По территории области проходят автомагистрали федерального значения М-8 Москва - Архангельск и А-114 Вологда - Новая Ладога. Кроме того, из областного центра - Вологды осуществляются пассажирские перевозки в населенные пункты всех районов области, что благотворно влияет на развитие внутреннего туризма.
В современном мире существенно возросла роль воздушного транспорта как наиболее быстрого средства перемещения на большие расстояния с высоким уровнем комфорта. Актуальными проблемами для Вологодской области, имеющей большую площадь, являются возможность путешествовать на значительные расстояния в наиболее короткий промежуток времени и авиадоступность ее отдаленных районов, в частности г. Великого Устюга.
Водный транспорт имеет огромное значение для развития туризма. По территории области пролегает почти 500-километровая трасса Волго-Балтийского водного пути, тысячи километров судоходных рек и озер, которые являются основными точками приема большинства потоков транзитных зарубежных и многих отечественных туристов.
Стоянки для приема туристских теплоходов находятся в г. Вытегре и г. Череповце, д. Ирме Шекснинского района, с. Горицы Кирилловского района, последняя является одной из крупнейших стоянок в системе круизных туристских маршрутов России и относится к организованному круизному маршруту по Волго-Балтийскому водному пути.