С учетом сложности, комплексности и масштабности реализации задач, связанных с созданием Системы, предлагается многоуровневая система управления процессом ее создания, включающая в себя уровни стратегического управления, заказчика (пользователя), исполнителя.
Правительство Республики Башкортостан обеспечивает управление созданием Системы, в том числе принимает необходимые нормативные правовые акты по разработке, внедрению и сопровождению Системы.
Государственный комитет Республики Башкортостан по размещению государственных заказов осуществляет координацию работы республиканских органов исполнительной власти по разработке, созданию и внедрению Системы, а также методологическое сопровождение работ по проектированию, внедрению и эксплуатации компонентов Системы в части функций по регулированию контрактной системы и определению поставщиков (исполнителей, подрядчиков) для заказчиков.
Государственный комитет по информатизации и вопросам функционирования системы "Открытая Республика" осуществляет работу по подготовке технического решения по проектированию и созданию Системы, выступает заказчиком на выполнение работ, связанных с проектированием, созданием, внедрением и эксплуатацией компонентов Системы, а также обеспечивает взаимодействие с оператором Системы.
Министерство финансов Республики Башкортостан осуществляет методологическое сопровождение работ по проектированию, внедрению и эксплуатации компонентов Системы в части обеспечения увязки Системы с организацией бюджетного процесса и выполнения возложенных на финансовый орган контрольных функций.
Министерство экономического развития Республики Башкортостан осуществляет методологическое сопровождение работ по проектированию, внедрению и эксплуатации компонентов Системы в части обеспечения увязки Системы с компонентами программно-целевого управления регионального сегмента государственной автоматизированной системы "Управление" и внедрения принципов нормирования в сфере закупок.
К реализации мероприятий настоящей Концепции привлекаются иные органы исполнительной власти Республики Башкортостан.