Основными задачами Госкомитета являются:
2.1. Осуществление межотраслевой координации в сфере развития арктических и северных территорий Республики Саха (Якутия), определение принципов и методов государственного регулирования по обеспечению достижения устойчивого развития арктических и северных территорий Республики Саха (Якутия).
2.2. Межотраслевая координация и реализация государственных программ Российской Федерации, государственных программ Республики Саха (Якутия), направленных на социально-экономическое развитие арктических и северных районов Республики Саха (Якутия).
2.3. Совершенствование системы государственного управления в сфере развития арктических и северных территорий Республики Саха (Якутия), в том числе за счет расширения фундаментальных и прикладных научных исследований в Арктике.
2.4. Разработка комплекса мер по развитию традиционных отраслей Севера и рыбохозяйственного комплекса, направленных на обеспечение достижения экономической эффективности, повышение качественных показателей государственных учреждений, предприятий и организаций, занятых в данных отраслях.
2.5. Взаимодействие с федеральными и республиканскими органами государственной власти по внесению изменений в законодательство Российской Федерации и Республики Саха (Якутия), направленных на реализацию перспектив устойчивого развития арктических и северных территорий Республики Саха (Якутия).
2.6. Разработка комплекса мер по развитию традиционных отраслей хозяйствования, обеспечивающих укрепление занятости и самозанятости коренных малочисленных народов Севера, созданию условий для саморазвития и самообеспечения в местах их компактного проживания.