Проблема борьбы с инфекционными заболеваниями является одной из наиболее важных проблем охраны здоровья населения республики. Число больных инфекционными заболеваниями в республике колеблется от 124 до 935 тысяч человек в год, что приводит к значительным экономическим потерям. Главным направлением в снижении инфекционной заболеваемости является вакцинопрофилактика. Современные вакцины защищают от инфекции более 90% привитых.
За последние 5 лет в республике уровень охвата прививками детей в возрасте до 2 лет увеличился с 68% до 90%. В результате показатель заболеваемости дифтерией за этот период снизился в 175 раз, корью - в 4 раза, коклюшем - в 5 раз.
Вместе с тем эпидемическая ситуация в Республике Башкортостан остается нестабильной. В 1999 году во время эпидемического подъема паротитом заболели более 6 тысяч человек. Участились случаи групповых заболеваний среди школьников. Краснухой в 1999 году переболели более 22 тысяч человек. Заболевание краснухой беременных женщин создает угрозу рождения детей с пороками развития. На высоком уровне регистрируется заболеваемость вирусным гепатитом. Ежегодное число больных превышает тысячу человек, большинство из них - люди трудоспособного возраста.
Из-за недостаточного финансирования иммунизация населения групп риска против паротита, краснухи, вирусного гепатита B проводится в крайне ограниченном объеме.
Не создана единая компьютерная сеть, обеспечивающая передачу и сбор информации о состоянии коллективного иммунитета населения.
Из-за недостаточного обеспечения холодильным оборудованием в сельской местности не всегда соблюдаются условия хранения и транспортировки вакцин.
Все вышеизложенное явилось основанием для разработки республиканской целевой программы "Вакцинопрофилактика" на 2001-2005 годы.