В соответствии с возложенными задачами комитет осуществляет следующие функции:
3.1. Формирует банк данных национальных, религиозных и других общественных организаций (объединений), находящихся на территории края.
3.2. Осуществляет мониторинг общественно-политической ситуации в крае, проводит сбор и анализ информации об основных тенденциях в данной сфере. В установленном порядке представляет государственным органам статистические и аналитические данные.
3.3. Участвует в подготовке и реализации, совместно с органами исполнительной власти края, федеральных и краевых проектов, программ и мероприятий. Обеспечивает организационно-методическое сопровождение указанных проектов, программ и мероприятий.
3.4. В пределах установленной компетенции осуществляет контроль за соблюдением требований федерального и краевого законодательства в сфере деятельности национальных, религиозных и других общественных организаций (объединений). В необходимых случаях в установленном порядке уведомляет соответствующие государственные органы о случаях нарушения действующего законодательства.
3.5. Организует проведение религиоведческих экспертиз.
3.6. Взаимодействует и координирует свою деятельность с федеральными органами государственной власти и органами исполнительной власти края, органами местного самоуправления Красноярского края, средствами массовой информации, в пределах установленной компетенции осуществляет межрегиональные и международные связи.
3.7. Проводит совещания, семинары, конференции и симпозиумы по вопросам, относящимся к компетенции комитета.
3.8. Принимает участие в разработке и согласовании проектов постановлений, распоряжений Совета администрации Красноярского края, указов и распоряжений Губернатора Красноярского края, законов Красноярского края, а также договоров и соглашений по вопросам, относящимся к компетенции комитета.
3.9. Ведет бухгалтерский учет и статистическую отчетность в соответствии с действующим законодательством.
3.10. Осуществляет иные функции, вытекающие из задач комитета.