Реализация Государственной программы организуется и координируется ответственным исполнителем, который размещает на своем веб-узле портала органов государственной власти Ярославской области информацию о ходе и результатах реализации Государственной программы, ее финансировании и другие материалы. Реализация Государственной программы осуществляется по проектному принципу. Перечень проектов, планируемых к реализации в очередном году, и их руководителей формируется межфункциональной группой и утверждается куратором Государственной программы. Работа по каждому проекту может осуществляться межфункциональной группой, в которую привлекаются специалисты структурных подразделений аппарата Правительства области, ОИВ, ОМСУ, сотрудники участвующих в реализации Государственной программы организаций и внешние эксперты. Участие специалистов структурных подразделений аппарата Правительства области и ОИВ в межфункциональных группах предварительно согласовывается с руководителями структурных подразделений аппарата Правительства области и ОИВ. Периодичность и форма отчетности по проектам определяется ответственным исполнителем Государственной программы по согласованию с куратором Государственной программы.
Контроль за целевым использованием средств областного бюджета, направленных на реализацию Государственной программы, осуществляется в соответствии с действующим законодательством.