Реализация Программы рассчитана на 9-летний период (2017-2025 годы). Вместе с тем сроки реализации Программы могут быть уточнены с учетом избранного варианта решения проблем, экономических и иных возможностей Российской Федерации.
Исходя из нормативных сроков проектирования и строительства новых следственных изоляторов (2 года - проектирование и 3-4 года - строительство) требуются значительные временные затраты и необходимость постоянного осуществления комплекса мер по обеспечению развития уголовно-исполнительной системы, приведению ее основных характеристик в соответствие с предъявляемыми требованиями.
В связи с этим Программу предполагается реализовать в один этап, поскольку ее мероприятия связаны между собой и носят долгосрочный характер.