3.1. Начальник отдела.
3.2. Заместители начальника отдела.
3.3. Главная бухгалтерия.
3.4. Группа по защите государственной тайны и документационного обеспечения.
3.5. Юридическая служба.
3.6. Группа собственной безопасности.
3.7. Организационно-аналитическая группа.
3.8. Дежурная служба.
3.9. Пресс-служба.
3.10. Группа по организации мобилизационной подготовки и гражданской обороны.
3.11. Оперативная группа.
3.12. Группа режима и надзора.
3.13. Группа по контролю за исполнением наказаний, не связанных с изоляцией осужденных от общества.
3.14. Группа розыска.
3.15.Группа специального учета.
3.16. Инспекция ведомственной пожарной охраны.
3.17. Группа организации службы охраны.
3.18. Группа инженерно-технического обеспечения, связи и вооружения.
3.19. Отдел специального назначения.
3.20. Группа кадров, воспитательной и социальной работы с личным составом.
3.21. Группа пенсионного обеспечения.
3.22. Инспекция по личному составу и противодействию коррупции.
3.23. Группа воспитательной, социальной и психологической работы с осужденными.
3.24. Группа тылового обеспечения.
3.25. Энергомеханическая группа.