Комиссия имеет следующие полномочия:
1) координировать деятельность по сохранению, воспроизводству, рациональному использованию совместных водных биологических ресурсов;
2) вносить изменения в перечень видов совместных водных биологических ресурсов;
3) ежегодно определять общие допустимые уловы совместных водных биологических ресурсов и распределять их на национальные квоты;
4) устанавливать критерии распределения общего допустимого улова совместных водных биологических ресурсов на национальные квоты;
5) согласовывать объемы вылова национальной квоты осетровых видов рыб в случае ее передачи другой Стороне, осуществляющей их промысел в своих реках;
6) регулировать промысел и сохранение совместных водных биологических ресурсов на основе ограничений промысла, которые могут включать следующие меры:
- запрет промысла в определенных районах и в отношении отдельных видов водных биологических ресурсов на определенные периоды;
- сезонное закрытие промысла в определенных районах и в отношении отдельных видов водных биологических ресурсов;
- установление минимального размера и веса добываемых (вылавливаемых) водных биологических ресурсов;
- определение размера ячеи и конструкции орудий добычи (вылова) водных биологических ресурсов;
- иные согласованные ограничения промысла;
7) рассматривать представленные отчеты об освоении квот на вылов совместных водных биологических ресурсов и отчеты по реализации Сторонами других решений Комиссии;
8) рассматривать данные промысловой статистики, включая количество судов, участвующих в промысле, и осуществленный ими вылов;
9) утверждать правила рыболовства в отношении совместных водных биологических ресурсов;
10) разрабатывать и утверждать необходимые программы и проекты по охране редких и находящихся под угрозой исчезновения видов совместных водных биологических ресурсов, перечень которых утверждается Комиссией, и среды их обитания;
11) утверждать и координировать согласованные программы научно-исследовательских работ по совместным водным биологическим ресурсам, устанавливать периодичность проведения таких работ;
12) сотрудничать с соответствующими специализированными международными организациями для достижения целей данного Соглашения;
13) содействовать разрешению спорных вопросов в области сохранения, воспроизводства и рационального использования совместных водных биологических ресурсов;
14) обеспечивать процедуру совместной оценки количественных и качественных характеристик выпускаемой молоди;
15) создавать рабочие группы, определять направления и программы их деятельности;
16) осуществлять мониторинг исполнения принятых решений;
17) устанавливать экспортные квоты в отношении осетровых видов рыб и продукции из них;
18) осуществлять иные функции и принимать другие решения, которые могут оказаться необходимыми для реализации настоящего Соглашения.