9.1. Министерство в рамках установленной компетенции осуществляет от имени Российской Федерации полномочия учредителя в отношении организаций, созданных Российской Федерацией для выполнения работ, оказания услуг в целях обеспечения реализации предусмотренных законодательством Российской Федерации полномочий Минприроды России.
9.2. Министерство осуществляет полномочия по управлению подведомственными организациями, проводит проверки их финансово-хозяйственной деятельности и использования имущественного комплекса, формирует и утверждает государственные задания для них, а также осуществляет иные, определенные законодательством Российской Федерации, полномочия в отношении подведомственных организаций.
9.3. По решению Министра отдельные полномочия по обеспечению взаимодействия Министерства с подведомственными ему организациями, а также по координации их деятельности, за исключением полномочий, отнесенных к исключительной компетенции Министра, могут быть распределены между заместителями Министра или возложены на директоров департаментов Министерства.
9.4. Обращения, запросы, отчеты и иные документы, созданные и оформленные в установленном порядке в процессе взаимодействия между Министерством и его подведомственными организациями, подлежат обязательной регистрации в системе документооборота Министерства в порядке, предусмотренном Инструкцией по делопроизводству в Минприроды России и иными актами Министерства.