В Программу предполагается включить подпрограммы "Экспедиционные исследования в Мировом океане", "Комплексные исследования Антарктики", "Прикладные исследования природы Мирового океана", "Совершенствование информационного обеспечения морской деятельности", а также мероприятия государственного заказчика-координатора.
Реализация Программы предполагается в 2016-2031 годах в 3 этапа - 1-й этап - 2016-2021 годы, 2-й этап - 2022-2026 годы, 3-й этап - 2027-2031 годы.