Многоаспектность и комплексность проблемы изучения Мирового океана и Антарктики в целях освоения и эффективного использования ресурсного потенциала и пространств Мирового океана в интересах экономического развития и обеспечения национальной безопасности России обусловлены совокупностью взаимосвязанных задач, решение которых требует координации деятельности органов власти федерального и регионального уровней, организаций различного профиля и организационно-правовых форм.
Механизм реализации Программы включает комплекс мер, осуществляемых государственным заказчиком - координатором Программы в целях повышения эффективности реализации отдельных мероприятий и достижения планируемых результатов в целом.
Основные функции государственного заказчика - координатора Программы должны заключаться:
в разработке новых подходов и инструментов системного решения задач морской деятельности Российской Федерации и обеспечения российского присутствия в Антарктике, а также механизмов привлечения средств внебюджетных источников;
в системном анализе развития морской деятельности и деятельности по исследованию Антарктики, результатов совершенствования информационного обеспечения этой деятельности, а также оценке результативности бюджетных расходов.
Управление и контроль за реализацией мероприятий и координацию деятельности государственных заказчиков подпрограмм Программы осуществляет в установленном порядке государственный заказчик - координатор Программы.