Реализация Концепции осуществляется в 3 этапа.
На I этапе планируется предпроектное обследование и проектирование межведомственной системы, а также подготовка проектов необходимых изменений в законодательство Российской Федерации.
Завершение I этапа предусматривается 30 декабря 2014 года.
На II этапе планируется разработка межведомственной системы и внесение необходимых изменений в законодательство Российской Федерации.
Завершение II этапа предусматривается 30 декабря 2015 года.
На III этапе планируется опытная эксплуатация и ввод в промышленную эксплуатацию межведомственной системы.
Завершение III этапа предусматривается 30 декабря 2016 года.