Начальной точкой границы Молочненского сельского поселения является точка 1, расположенная на стыке границ муниципальных образований Воробьевского, Молочненского и Штормовского сельских поселений Сакского района.
От точки 1 граница проходит в юго-восточном направлении на протяжении 1556 м по территории Воробьевского и Молочненского сельских поселений Сакского района вдоль автомобильной дороги на городской округ Евпатория до точки 2 полевая дорога.
От точки 2 граница проходит в северо-восточном направлении на протяжении 1173 м по полевой дороге до точки 7 лесополоса.
От точки 7 граница проходит в восточном направлении на протяжении 1630 м по лесополосе до точки 8 полевая дорога.
От точки 8 граница проходит на восток на протяжении 2618 м по полевой дороге до точки 19, расположенной на стыке границ муниципальных образований Воробьевского, Молочненского и Ромашкинского сельских поселений Сакского района.
От точки 19 граница проходит в южном направлении на протяжении 2031 м по территории Молочненского и Ромашкинского сельских поселений Сакского района вдоль оросительного канала до точки 21 лесополоса.
От точки 21 граница проходит на юг на протяжении 1495 м по лесополосе до точки 26 полевая дорога.
От точки 26 граница проходит в юго-восточном направлении на протяжении 1553 м по полевой дороге до точки 32, расположенной на стыке границ муниципальных образований Уютненского, Молочненского и Ромашкинского сельских поселений Сакского района.
От точки 32 граница проходит в южном направлении на протяжении 434,5 м по территории Молочненского и Уютненского сельских поселений Сакского района вдоль автомобильной дороги на с. Ромашкино до точки 33 пересечение лесополосы и автодороги.
От точки 33 граница проходит в южном направлении на протяжении 5039 по лесополосе до точки 39 полевая дорога.
От точки 39 граница проходит в западном направлении на протяжении 1493 м по полевой дороге до точки 45 полевая дорога.
От точки 45 граница проходит на юго-запад на протяжении 501,3 м по полевой дороге до точки 52 лесополоса.
От точки 52 граница проходит в юго-западном направлении на протяжении 1287 м по лесополосе вдоль автомобильной дороги до точки 64, расположенной на стыке границ муниципальных образований Уютненского и Молочненского сельских поселений Сакского района.
От точки 64 граница проходит на северо-запад на протяжении 10490 м по территории Молочненского сельского поселения Сакского района по береговой линии Черного моря до точки 240, расположенной на стыке границ муниципальных образований Штормовского и Молочненского сельских поселений Сакского района.