5.1. Управление возглавляет начальник, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором города Севастополя в установленном порядке.
5.2. В период временного отсутствия начальника Управления (в связи с болезнью, командировкой и по другим причинам) его обязанности исполняет заместитель начальника Управления.
5.3. Управление осуществляет деятельность на основе квартальных планов проверок (ревизий), подлежащих согласованию с Губернатором города Севастополя, и формируемых исходя из необходимости обеспечения всестороннего системного контроля. Внеплановые проверки (ревизии) и иные контрольные мероприятия проводятся Управлением по поручению Губернатора города Севастополя.
5.4. Начальник Управления:
5.4.1. Организует работу Управления и контролирует его деятельность.
5.4.2. Осуществляет планирование деятельности Управления.
5.4.3. Утверждает положения о его структурных подразделениях Управления.
5.4.4. Отчитывается перед Губернатором города Севастополя и Правительством Севастополя по результатам деятельности Управления.
5.4.5. Осуществляет в установленном порядке расходование денежных средств в пределах выделенных ассигнований, обеспечивает соблюдение финансовой дисциплины и повышение эффективности использования средств бюджета города Севастополя, предусмотренных на содержание Управления и реализацию возложенных на него полномочий.
5.4.6. Подписывает в пределах своей компетенции правовые акты (приказы, распоряжения) Управления, осуществляет контроль за их исполнением.
5.4.7. Обеспечивает эффективное использование и сохранность имущества города Севастополя, закрепленного за Управлением.
5.4.8. Действует без доверенности от имени Управления, заключает от имени Управления договоры и соглашения, совершает иные юридические действия.
5.4.9. Представляет Управление в федеральных органах государственной власти, иных государственных органах, органах местного самоуправления, в организациях, общественных объединениях граждан.
5.4.10. Исполняет полномочия представителя нанимателя для государственных гражданских служащих Управления и работодателя для работников Управления, замещающих должности, не являющиеся должностями государственной гражданской службы, в соответствии с законодательством о государственной гражданской службе и трудовым законодательством Российской Федерации.
5.4.11. Обеспечивает соблюдение государственными гражданскими служащими законодательства о государственной гражданской службе, служебной дисциплины, коллективных договоров, правил служебного распорядка, должностных регламентов
5.4.12. Несет ответственность за соблюдение установленного федеральными законами, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, законами города Севастополя, иными правовыми актами города Севастополя режима защиты конфиденциальной информации, а также информации, отнесенной к государственной, коммерческой, служебной, иной тайне.
5.4.13. Подписывает бухгалтерскую и статистическую отчетность Управления.
5.4.14. Представляет на утверждение Правительства Севастополя структуру и штатную численность Управления.
5.4.15. Выполняет иные полномочия в соответствии с законодательством.
5.5. Начальник Управления вправе делегировать отдельные предоставленные ему полномочия своим заместителям.
5.6. Права и обязанности сотрудников и работников Управления определяются федеральным и региональным законодательством должностными регламентами (должностными инструкциями).
5.7. Управление в установленном порядке осуществляет бюджетный статистический и оперативный учет, представление отчетности.
5.8. Порядок осуществления Управлением полномочий финансовому контролю устанавливается положением, утверждаемым Правительством Севастополя.
5.9. Для рассмотрения вопросов планирования, результатов контрольной деятельности в Управлении образуется Коллегия под председательством начальника Управления. Порядок формирования и организации работы Коллегии определяется соответствующим Положением, утверждаемым начальником Управления.