Показатель общей заболеваемости населения автономного округа за последние пять лет имеет стабильное значение с 2-процентным ростом. В сравнении с 2011 годом произошло снижение на 3%, показатель составил 2007,2 на тысячу населения (по УрФО - 1509,9 и по РФ - 1604,0 на 1000 населения).
В период с 2008 по 2012 годы максимальный уровень как общей, так и впервые выявленной заболеваемости был зарегистрирован в 2011 году (2069,0 и 1193,8 на 1000 населения соответственно). Данная ситуация объясняется в первую очередь увеличением выявляемости заболеваний. В 2011 - 2012 годах, благодаря реализации региональной программы модернизации здравоохранения, окружных целевых программ, национального проекта "Здоровье" было закуплено новое оборудование, проведены ремонты зданий медицинских организаций, внедрены стандарты оказания стационарной медицинской помощи, в результате чего удалось увеличить доступность медицинской помощи и, как следствие, выявляемость заболеваний.