Важной проблемой является строительство крупных объектов здравоохранения ввиду высокой дотационности республики.
В связи с тем, что в республике отсутствует учреждение для оказания санаторно-курортного лечения больных с бронхо-легочной патологией, планируется до 2020 года строительство санаторно-курортного учреждения в г. Теберда для реабилитации данной категории больных.
В рамках государственно-частного партнерства предусмотрено открытие в Малокарачаевском районе Центра реабилитации и гериатрии.
Министерством здравоохранения Карачаево-Черкесской Республики запланировано также создание до 2020 года частного диагностического центра в г. Черкесске.