В ходе реализации мер, направленных на развитие инновационной системы, обеспечено сопровождение инновационных проектов следующими российскими институтами развития:
филиалом Фонда содействия. В Алтайском крае филиал Фонда содействия функционирует с 1996 года. В 2010 году подписано соглашение о взаимодействии между Администрацией Алтайского края и Фондом содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере. За последние восемь лет региональными исследователями подана 681 заявка, заключено 208 государственных контрактов на общую сумму 141 млн рублей;
РФФИ и РГНФ. В целях консолидации усилий по поддержке исследований, направленных на решение особо важных для региона проблем, между Администрацией края и РФФИ подписано Соглашение о проведении совместного конкурса проектов в 2011 - 2015 годах. Совместно с РГНФ на основании заключенного на 2011 - 2015 годы соглашения ежегодно организуется конкурс проектов "Российское могущество прирастать будет Сибирью и Ледовитым океаном" в области гуманитарных наук;
РОСНАНО. Основной инфраструктурной составляющей нанотехнологической сети региона является МРЦН, созданный в 2007 году на базе наукограда Бийска. Членами ассоциации являются 12 организаций Алтайского края, Новосибирской и Томской областей. В 2008 году МРЦН вошел в состав Российской национальной ассоциации наноиндустрии. С 2012 года на базе Алтайского государственного технического университета им. И.И.Ползунова стартовала пилотная образовательная программа профессиональной переподготовки специалистов в области производства полимерных энергонасыщенных и нанокомпозиционных материалов. Проект общей стоимостью 17 млн рублей профинансирован Администрацией Алтайского края и Фондом инфраструктурных и образовательных программ РОСНАНО на паритетной основе. В первом выпуске - 75 специалистов организаций наноиндустрии региона, одна из групп слушателей прошла стажировку в Российско-французском центре трансфера технологий (г. Безансон, Франция). Ежегодно планируется осуществлять профессиональную переподготовку порядка 30 специалистов;
Внешэкономбанком. Соглашение о сотрудничестве заключено в декабре 2008 года. Основное взаимодействие сторон осуществляется в рамках реализации крупных проектов краевой программы "Комплексное развитие Алтайского Приобья". Так, совместно с Внешэкономбанком на территории края реализуется приоритетный проект по строительству и техническому оснащению свиноводческого комплекса на 300000 голов в год (ООО "Алтаймясопром");
Роспатентом. Основу сотрудничества Роспатента и Администрации края определяет подписанное в 2009 году соглашение. В рамках его реализации в 2013 году в целях повышения эффективности использования патентной информации открыт региональный ЦПТИ. Центр на бесплатной основе предоставляет доступ к специализированным базам данных ФГБУ "Федеральный институт промышленной собственности", Евразийской патентно-информационной системы и другим. В рамках информационного обслуживания с учетом конкретных потребностей и специфики деятельности предприятий специалистами ЦПТИ осуществляется консультирование по вопросам проведения патентных исследований, подготовке лицензионных договоров, а также патентный поиск (тематический, именной, нумерационный) по отечественным и зарубежным базам данных;
технологическими платформами. На сегодняшний день технологические платформы входят в число важнейших инструментов, позволяющих объединить усилия бизнеса, науки, образования и государства для реализации приоритетных направлений модернизации и технологического развития экономики. В 2011 - 2013 годах в соответствии с решениями Правительственной комиссии по высоким технологиям и инновациям был утвержден перечень из 34 технологических платформ.
Организации Алтайского края входят в состав девяти технологических платформ (таблица 3).