Координатором программы является управление Алтайского края по пищевой, перерабатывающей, фармацевтической промышленности и биотехнологиям, которое в пределах своих полномочий совместно с иными органами исполнительной власти Алтайского края и заинтересованными организациями осуществляет необходимые действия по ее реализации, в том числе:
формирует межведомственный экспертный совет, включающий представителей бизнеса, науки и образования, органов исполнительной власти, принимающих активное участие в развитии биотехнологий;
организует во взаимодействии с исполнителями мониторинг достижения и при необходимости ежегодную корректировку целевых индикаторов мероприятий программы, а также оценку ее результативности;
представляет статистическую, справочную, аналитическую информацию о ходе реализации программы.
Органы исполнительной власти Алтайского края и заинтересованные организации - ответственные исполнители программы по основным мероприятиям: Главное управление экономики и инвестиций Алтайского края, Главное управление сельского хозяйства Алтайского края, Главное управление природных ресурсов и экологии Алтайского края, управление Алтайского края по развитию предпринимательства и рыночной инфраструктуры, КГБУ "Алтайский центр кластерного развития", НП "Алтайский биофармацевтический кластер" (по согласованию).