Правительство Республики Алтай для изучения и подготовки важных вопросов образует постоянные комиссии, определяет их задачи, функции и порядок деятельности.
Для подготовки предложений по отдельным вопросам государственного управления, разработки проектов решений Правительства Республики Алтай, рассмотрения разногласий по представленным проектам, а также для выполнения отдельных поручений Правительства Республики Алтай могут создаваться временные комиссии и другие рабочие органы Правительства Республики Алтай.