Управление охраной окружающей природной среды осуществляется для организации и выполнения мер по обеспечению качества окружающей природной среды и реализации экологических программ.
Государственное управление охраной природной среды в Республике Марий Эл осуществляется Правительством Республики Марий Эл, местными администрациями, Министерством экологии и природопользования Республики Марий Эл и его органами на местах, другими специально уполномоченными органами охраны природы.