В выполнении Программы участвуют органы исполнительной власти Республики Дагестан, которые несут ответственность за своевременную реализацию мероприятий Программы, успешное решение задач, рациональное использование выделенных денежных средств.
Министерство здравоохранения Республики Дагестан обеспечивает координацию взаимодействия участников Программы, анализ и обобщение результатов их деятельности.
Исполнители мероприятий Программы дважды в год (до 20 января и до 20 июля) направляют в Министерство здравоохранения Республики Дагестан аналитическую справку о реализации программных мероприятий, достигнутых результатах, перспективах работы.
Контроль за реализацией Программы осуществляет Правительство Республики Дагестан.