Основаниями прекращения договора о пользовании природной средой и природными ресурсами являются:
1) истечение срока пользования природной средой и природными ресурсами;
2) нарушение условий договора одной из сторон;
3) заявление природопользователя;
4) невнесение платы за пользование природной средой и природными ресурсами;
5) ликвидация предприятий, организаций, учреждений либо иных организаций, пользующихся правом на природопользование;
6) изъятие объектов природной среды и природных ресурсов из обособленного пользования для государственных и общественных нужд.
Действие договора о пользовании природной средой и природными ресурсами может быть прекращено и по другим основаниям, предусмотренным действующим законодательством. Аннулирование разрешения на пользование природной средой и природными ресурсами производится по тем же основаниям, что и при прекращении указанного договора.