К полномочиям Правительства Республики Карелия относятся:
1) определение уполномоченного органа;
2) утверждение государственных программ Республики Карелия в сфере организации транспортного обслуживания населения;
3) утверждение порядка предоставления из бюджета Республики Карелия субсидий юридическим лицам, осуществляющим перевозки пассажиров и багажа воздушным транспортом в межмуниципальном и пригородном сообщении и железнодорожным транспортом в пригородном сообщении;
4) утверждение регионального стандарта транспортного обслуживания населения;
5) установление порядка подготовки и реализации регионального комплексного плана транспортного обслуживания населения;
6) утверждение регионального комплексного плана транспортного обслуживания населения;
7) установление порядка установления, изменения, отмены межмуниципальных маршрутов регулярных перевозок на территории Республики Карелия (в том числе порядка рассмотрения заявлений юридических лиц, индивидуальных предпринимателей, участников договора простого товарищества об установлении, изменении либо отмене данных маршрутов, а также оснований для отказа в установлении либо изменении данных маршрутов, оснований для отмены данных маршрутов);
8) установление порядка согласования установления или изменения межмуниципального маршрута регулярных перевозок либо муниципального маршрута регулярных перевозок, имеющих два и более общих остановочных пункта с ранее установленным соответственно муниципальным маршрутом регулярных перевозок, межмуниципальным маршрутом регулярных перевозок;
9) утверждение положения о региональном государственном контроле (надзоре) на автомобильном транспорте, городском наземном электрическом транспорте и в дорожном хозяйстве;
10) установление ограничения по экологическим характеристикам транспортного средства, которое используется для осуществления перевозок по маршруту регулярных перевозок по нерегулируемым тарифам;
11) осуществление иных полномочий в соответствии с законодательством Российской Федерации и законодательством Республики Карелия.