Описание границ государственного природного комплексного заказника регионального значения "Нижнепонойский" приводится по значимым поворотным точкам, дополнительно указывается нумерация точек, внесенная в единый государственный реестр недвижимости, координаты точек указываются в системе WGS-84, при описании границы используются материалы лесоустройства 1998 - 2003 годов.
Фактически территория заказника проходит вдоль рек Лосинга, Поной и Русинга, образуя три неразрывных контура.
1. Река Лосинга.
Граница государственного природного комплексного заказника регионального значения "Нижнепонойский" берет начало с крайней северо-западной точки, расположенной на землях сельскохозяйственного назначения, в границах земельного участка с кадастровым номером 51:02:0060201:27, 1 (84083) с координатами 37,6187 восточной долготы и 67,6122 северной широты, которая расположена на проходящей тракторной дороге, в 1000 метрах на юг от озера Карманникум, в 3700 метрах на юго-запад от горы Карманникум с отметкой 377,5 метра, в 2500 метрах на северо-запад от горы Червурта с отметкой 368,8 метра.
От указанной точки граница заказника общим направлением на юго-восток, пересекая границу земель лесного фонда и далее проходя по территории лесного фонда, проходит на расстоянии в 1000 метров от восточного (левого) берега реки Лосинга, обходя с направлением по часовой стрелке на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков реки Лосинга и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы (таким образом, что названные притоки и водоемы входят в границы заказника) до точки 2 (233032) с координатами 37,7414 восточной долготы и 67,4716 северной широты, расположенной в 170 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 1800 метрах на север от зимней дороги (автозимника).
Далее граница заказника, меняя направление на северо-запад, проходит вдоль реки Червурта на расстоянии 250 метров от береговой линии, обходит по часовой стрелке притоки всех порядков до точки 3 (245428), где река Червурта разветвляется на Зап. Червурту и Вост. Червурту, точка расположена в 142 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества. Указанная точка имеет координаты 37.7464° восточной долготы и 67.4933° северной широты, граница заказника проходит в северо-западном направлении на расстоянии 250 метров вдоль береговой полосы реки Зап. Червурта, огибая на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы, обходит по часовой стрелке реку Зап. Червурта, огибая ее исток, расположенный за пределами границ лесного фонда, и в юго-восточном направлении возвращается к берегу реки Червурта (на указанном от нее расстоянии - 250 метров) в точку 4 (250103) с координатами 37.7543° восточной долготы и 67.5041° северной широты, расположенной в 142 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 750 метрах на север от места разветвления реки Червурта на Западную и Восточную. Притоки и водотоки Зап. Червурта расположены в 142, 114, 113, 86, 87 кварталах Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества. От точки 4 (250103) граница заказника проходит в северо-восточном направлении на расстоянии 250 метров вдоль береговой полосы реки Вост. Червурт, огибая на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы, обходит по часовой стрелке реку Вост. Червурта, в северной ее части выходя за границы земель лесного фонда, и в юго-западном направлении возвращается в точку 5 (230746) с координатами 37.7572° восточной долготы и 67.4966° северной широты, расположенной в 142 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 280 метрах на северо-запад от места разветвления реки Червурты на Западную и Восточную. Притоки и водотоки Вост. Червурта расположены в 88, 87, 114, 115 кварталах Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества.
Затем граница заказника продолжает свое движение в юго-западном направлении вдоль реки Червурта на расстоянии 250 метров от береговой линии, обходит по часовой стрелке 2 притока без названия с их водотоками до точки 6 (241335) с координатами 37.7660° восточной долготы и 67.4621° северной широты, расположенной в 170 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, расположенной в 800 метрах на юг от зимней дороги, в 6000 метрах на запад от горы Плохая с отметкой 283,9 метра.
Далее граница заказника общим направлением на юго-восток протяженностью 11800 метров проходит вдоль автозимника, на расстоянии в 1000 метров от восточного (левого) берега реки Лосинга, обходя с направлением по часовой стрелке на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков реки Лосинга и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы (таким образом, что названные притоки и водоемы входят в границы заказника), проходит на своем пути ур. Геофизическая Партия до точки 7 (227143) с координатами 38.0314° восточной долготы и 67.4309° северной широты, расположенной в 516 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 6350 метрах на юго-восток от горы Плохая с отметкой 283,9 метров.
Затем граница заказника общим направлением на северо-запад протяженностью 1380 метров проходит вдоль реки Колокольная на расстоянии 250 метров от ее береговой полосы до точки 8 (225811) с координатами 38.0232° восточной долготы и 67.4429° северной широты, расположенной в 516 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 5400 метрах на юго-восток от горы Плохая с отметкой 283,9 метра. От точки 8 (225811), где в реку Колокольная впадает река Кырпег, граница заказника продолжает движение вдоль реки Кырпег общим направлением на северо-запад протяженностью 4350 метров, обходя с направлением по часовой стрелке на расстоянии 250 метров от береговых линий приток таким образом, что названный участок входит в границы заказника, до точки 9 (226088) с координатами 37.9723° восточной долготы и 67.4771° северной широты, расположенной в 507 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 3180 метрах на северо-восток от горы Плохая с отметкой 283,9 метра. От точки 9 (226088), расположенной в месте впадения ручья Попов в реку Кырпег, граница заказника продолжает движение вдоль ручья на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков, включает притоки всех порядков ручья Попов и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы, огибает по часовой стрелке исток ручья Попов и в юго-восточном направлении возвращается в точку 10 (87729) с координатами 37.9862° восточной долготы и 67.4754° северной широты, расположенной в 507 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 3650 метрах на северо-восток от горы Плохая с отметкой 283,9 метра.
Далее граница заказника продолжает движение вдоль реки Кырпег общим направлением на северо-восток, огибая на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков и расположенные на данных притоках на расстоянии 250 метров от береговых линий водоемы, обходит по часовой стрелке исток реки Кырпег и в южном направлении возвращается в точку 11 (88657) с координатами 38.0209° восточной долготы и 67.4516° северной широты, расположенную в 516 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 6300 метрах на северо-восток от ур. Геофизическая Партия.
Затем граница заказника продолжает движение вдоль реки Колокольная, общим направлением на северо-восток на расстоянии 250 метров от ее береговой полосы, огибая на расстоянии 250 метров от береговых линий и истоков притоки всех порядков и расположенные на данных притоках на расстоянии 250 метров от береговых линий, водоемы, обходит по часовой стрелке исток реки Колокольная, пересекая границу 503 квартала Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, выходя за территорию лесного фонда, и в юго-западном направлении возвращается вдоль реки Колокольная в точку 12 (92046) с координатами 38.0488° восточной долготы и 67.4285° северной широты, расположенную в 516 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, расположенную в 1200 метрах на север от зимней дороги, проходящей вдоль реки Лосинга. Далее граница заказника общим направлением на юго-восток протяженностью 1030 метров проходит вдоль реки Лосинга на расстоянии в 1000 метров от ее береговой полосы, приходит в точку 13 (92062) с координатами 38.0710° восточной долготы и 67.4224° северной широты, расположенной в 517 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, расположенной в 1300 метрах на север от зимней дороги, проходящей вдоль реки Лосинга.
Затем граница, проходя в северо-восточном направлении обходит приток реки Карсим (Тавайок) на расстоянии 250 метров от ее береговой полосы, продолжает движение вдоль реки на расстоянии 250 метров от ее береговой полосы, огибая на расстоянии 250 метров множество ее притоков и водотоков разных порядков и расположенные на данных притоках водоемы без названия, огибает по часовой стрелке исток реки Карсим (Тавайок) и возвращаясь в юго-западном направлении вдоль реки Карсим (Тавайок), а также вдоль автозимника, приходит в точку 14 (94806) с координатами 38.1319° восточной долготы и 67.3959° северной широты, расположенной в 522 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, расположенной в 5200 метрах на северо-запад от горы Паввелькыр с отметкой 253,7 метра.
Далее граница заказника продолжает движение вдоль реки Куроптяевская общим направлением на северо-восток огибая на расстоянии 250 метров от береговых линий множество притоков всех порядков и на расстоянии 250 метров от береговых линий расположенные на данных притоках водоемы, обходит по часовой стрелке исток реки Куроптяевская, включая ручей Верх. Куроптяевский, и в юго-западном направлении возвращается в точку 15 (174853) с координатами 38.1704° восточной долготы и 67.4006° северной широты, расположенной в 523 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 900 метрах на север от зимней дороги, автозимника. От точки 15 (174853) граница заказника проходит в восточном направлении вдоль реки Ратвэй (Лабаз) на расстоянии 250 метров от ее береговой полосы, огибая и истоков притоки на расстоянии 250 метров от береговых линий всех порядков и на расстоянии 250 метров от береговых линий, расположенные на данных притоках водоемы, возвращается в западном направлении к реке Лосинга до точки 16 (176057) с координатами 38.1285° восточной долготы и 67.3913° северной широты, расположенной в 522 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 750 метрах на север от зимней дороги, автозимника.
Затем граница заказника общим направлением на юго-запад протяженностью 2600 метров вдоль восточного (левого) берега реки Лосинга обходит с направлением по часовой стрелке на расстоянии 250 метров от береговой полосы приток реки Лосинга без названия до точки 17 (234758) с координатами 38.0936° восточной долготы и 67.3722° северной широты, расположенной в 527 квартале Верхне-Понойского участкового лесничества Ловозерского лесничества, в 1500 метрах на юго-восток от зимней дороги, автозимника.