5.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Главой Республики Саха (Якутия) в установленном законодательством Республики Саха (Якутия) порядке.
5.2. Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и осуществление им своих функций.
5.3. Министр имеет заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности Главой Республики Саха (Якутия) в установленном порядке. Количество заместителей министра устанавливается решением Правительства Республики Саха (Якутия).
5.4. Полномочия заместителей министра утверждаются приказом Министерства о распределении обязанностей между министром, его заместителями и их взаимозаменяемости.
5.5. Министр:
5.5.1. Руководит деятельностью Министерства на принципах единоначалия.
5.5.2. Распределяет обязанности между первыми заместителями и заместителями министра.
5.5.3. Утверждает штатное расписание Министерства в пределах установленного фонда оплаты труда и предельной численности сотрудников, смету расходов на его содержание в пределах государственного бюджета Республики Саха (Якутия), утвержденных на соответствующий период бюджетных ассигнований, предусмотренных в государственном бюджете Республики Саха (Якутия).
5.5.4. Утверждает положения о структурных подразделениях Министерства.
5.5.5. Назначает в установленном порядке на должность и освобождает от должности сотрудников аппарата Министерства.
5.5.6. Утверждает в установленном порядке уставы подведомственных государственных учреждений Республики Саха (Якутия) и вносимые в них изменения в соответствии с типовым уставом, утверждаемым исполнительным органом государственной власти Республики Саха (Якутия), на который возложено управление государственным имуществом Республики Саха (Якутия), заключает и расторгает трудовые договоры (контракты) с руководителями подведомственных учреждений.
5.5.7. Рассматривает отчетность руководителей подведомственных учреждений.
5.5.8. Вносит в установленном порядке на рассмотрение Правительства Республики Саха (Якутия) проекты нормативных правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Министерства.
5.5.9. Издает в пределах своей компетенции приказы, инструкции и дает указания, подлежащие обязательному исполнению сотрудниками аппарата Министерства и подведомственных учреждений, проверяет их исполнение.