Территории объектов культурного наследия и зоны их охраны входят в Единый государственный реестр объектов культурного наследия. Согласно Земельному кодексу Российской Федерации, для территорий объектов культурного наследия устанавливается режим земель историко-культурного назначения.
Города Вологда и Череповец, находящиеся в границах агломерации, являются историческими поселениями регионального значения.
В границах агломерации расположено большое количество объектов культурного значения федерального, регионального и местного значения.