1. Низкая степень проточности водоемов.
На экологическое состояние водных объектов оказывает влияние процесс заиливания, в связи с чем состояние многих водных объектов за последние годы ухудшается.
Несмотря на построенные и введенные в эксплуатацию до 2019 года гидротехнические сооружения (шлюзы-регуляторы) на ильмене Табун-Киремта и ильмене Чапурий Голга в муниципальном образовании "Лиманский муниципальный район Астраханской области", на ерике Малая Дарма в муниципальном образовании "Наримановский муниципальный район Астраханской области" и на ильмене Соленая Дорога в муниципальном образовании "Икрянинский муниципальный район Астраханской области", серьезной проблемой для региона является изменение естественного природного функционирования экосистемы западных подстепных ильменей, расположенных на юго-востоке дельты р. Волги в границах муниципальных образований "Наримановский муниципальный район Астраханской области", "Икрянинский муниципальный район Астраханской области" и "Лиманский муниципальный район Астраханской области" площадью более 5 тыс. км2. Это приводит к вододефициту для населения, проживающего в данных муниципальных образованиях Астраханской области, и сдерживает устойчивое развитие сельского хозяйства и других сфер. Нарушение гидрологического режима водных объектов приводит к переформированию экосистем, нарушению экологического баланса, деградации почв и биоценозов.
2. Угроза затопления населенных пунктов, в том числе подтопления грунтовыми водами.
Отрицательное воздействие вод проявляется не только в виде заиления и зарастания русла водотоков, но и в виде подтопления грунтовыми водами большей части территории муниципального образования "Городской округ город Астрахань", затопления территорий населенных пунктов, городских территорий и сельскохозяйственных угодий во время высоких паводков.
Численность населения Астраханской области, проживающего на территориях, подверженных негативному воздействию вод (включая численность населения, проживающего на территориях, защищенных в результате строительства сооружений инженерной защиты, проведения работ по увеличению пропускной способности русел рек и других), составляет 480 тыс. человек или около 50% населения региона.
3. Высокий уровень загрязнения водных объектов неочищенными и недостаточно очищенными сточными водами.
Основными источниками загрязнения водных объектов являются организованные сбросы сточных вод из Волго-Каспийского бассейна, а также от предприятий прежде всего жилищно-коммунального хозяйства Астраханской области. Основным крупным предприятием - загрязнителем поверхностных вод на территории Астраханской области является муниципальное унитарное предприятие г. Астрахани "Астрводоканал".
Объем отводимых в р. Волгу загрязненных сточных вод составляет 0,04 км3 в год. Стабильное поступление загрязняющих веществ в совокупности с общим угнетением водных объектов ухудшает качество воды, снижает способность рек к самоочищению, отрицательно влияет на состояние водных биоресурсов и, учитывая недостаточность очистных сооружений водопровода в муниципальных образованиях Астраханской области, создает предпосылки для угрозы здоровья населения, потребляющего воду из водоемов области.
4. Ухудшение состояния гидротехнических сооружений либо их отсутствие.
Общее количество гидротехнических сооружений на территории Астраханской области составляет 388 единиц.
Весеннее половодье и естественные русловые процессы негативным образом воздействуют на береговую линию. Водооградительные земляные валы, возведенные еще в прошлом столетии, ежегодно ремонтируются до и после половодья, однако при высоких уровнях воды не смогут обеспечить должного уровня безопасности населения и инфраструктуры. Прогнозируемый экономический ущерб от возможного затопления населенных пунктов исчисляется десятками миллиардов рублей.
В настоящее время количество гидротехнических сооружений, которым необходимо проведение капитального ремонта, составляет 12 единиц на протяженности 22,5 км.
5. Сохранение площади лесов, в том числе на основе их воспроизводства на участках вырубленных и погибших лесных насаждений, и лесоразведение.