Министерство осуществляет следующие полномочия:
2.1. Реализация на территории Ярославской области государственной политики и осуществление государственного управления в сфере охраны окружающей среды и природопользования.
2.2. Разработка лесного плана Ярославской области, лесохозяйственных регламентов, а также проведение государственной экспертизы проектов освоения лесов (за исключением случаев, предусмотренных пунктом 18.2 статьи 81 Лесного кодекса Российской Федерации).
2.3. Предоставление в границах земель лесного фонда лесных участков в постоянное (бессрочное) пользование, аренду (за исключением случаев, предусмотренных пунктом 18.1 статьи 81 Лесного кодекса Российской Федерации), безвозмездное пользование, а также заключение договоров купли-продажи лесных насаждений.
2.4. Организация использования лесов, их охраны (в том числе осуществления мер пожарной безопасности и тушения лесных пожаров и других ландшафтных (природных) пожаров, за исключением выполнения взрывных работ в целях локализации и ликвидации лесных пожаров и других ландшафтных (природных) пожаров и осуществления мероприятий по искусственному вызыванию осадков в целях тушения лесных пожаров и других ландшафтных (природных) пожаров), защиты (за исключением лесозащитного районирования и государственного лесопатологического мониторинга), воспроизводства (за исключением лесосеменного районирования, формирования федерального фонда семян лесных растений и государственного мониторинга воспроизводства лесов) на землях лесного фонда и обеспечение охраны, защиты, воспроизводства лесов (в том числе создание и эксплуатация лесных дорог, предназначенных для использования, охраны, защиты и воспроизводства лесов) на указанных землях.
2.5. Осуществление следующих видов государственного контроля (надзора):
- региональный государственный экологический контроль (надзор) при осуществлении хозяйственной и иной деятельности, за исключением деятельности с использованием объектов, подлежащих федеральному государственному экологическому контролю (надзору);
- региональный государственный контроль (надзор) в области охраны и использования особо охраняемых природных территорий Ярославской области регионального значения, за исключением особо охраняемых природных территорий Ярославской области регионального значения, которые находятся под управлением государственных бюджетных учреждений;
- региональный государственный геологический контроль (надзор);
- федеральный государственный лесной контроль (надзор);
- федеральный государственный контроль (надзор) в области охраны, воспроизводства и использования объектов животного мира и среды их обитания на территории Ярославской области, за исключением объектов животного мира и среды их обитания, находящихся на особо охраняемых природных территориях федерального значения, расположенных на территории Ярославской области;
- федеральный государственный охотничий контроль (надзор) на территории Ярославской области, за исключением особо охраняемых природных территорий федерального значения, расположенных на территории Ярославской области.
2.6. Осуществление лесной охраны в лесах, расположенных на землях лесного фонда.
2.7. Участие в проведении государственной политики и нормативно-правовом регулировании в области обращения с отходами, в том числе с твердыми коммунальными отходами, на территории Ярославской области.